The Phantom Agony es el primer álbum de estudio de larga duración de la banda holandesa de metal sinfónico Epica. Fue lanzado en 2003 por el sello holandés Transmission Records. Es el primer álbum grabado por el guitarrista Mark Jansen tras su salida de la banda After Forever.
En este álbum, Jansen continúa con la colección de canciones que componen The Embrace That Smothers. Las primeras tres partes se pueden encontrar en Prison of Desire (2000), el álbum debut de After Forever, y las siguientes tres partes se pueden encontrar en The Divine Conspiracy (2007), el tercer álbum de Epica. Estas canciones tratan sobre los peligros de la religión organizada.
El álbum fue relanzado el 23 de marzo de 2013, que coincidió con el show Retrospect del décimo aniversario de Epica, como una edición ampliada de 2 discos por el antiguo sello discográfico de Epica, Transmission Records.
